ふるさと納税の確定申告でつまずく所【2026年版】XMLが読み込めない・マイナポータル連携できない・証明書紛失

ふるさと納税の確定申告で手が止まる場所は、ほぼ証明書まわりの3つです。マイナポータル連携ができない、XMLデータが読み込めない、証明書をなくした。

先に結論を書くと、どれも回り道があります。紙の受領証明書が1枚もなくても申告はできますし、XMLが使えなくても手入力で通ります。

症状別・どこで詰まっているか

証明書には3種類あります

混乱の元は、呼び名の違う書類が3つあることです。

• 寄附金受領証明書：寄付先の自治体が発行する紙。寄付するたびに1枚ずつ届きます
• 寄附金控除に関する証明書（電子データ）：国税庁長官が指定した特定事業者（ふるさと納税ポータルサイト）が発行する、年間の寄付をまとめたデータ。国税庁指定のXML形式で、PDFでは受け付けられません
• 寄附金控除に関する証明書（書面）：同じ内容を紙で受け取ったもの

令和3年分の確定申告から、自治体ごとの受領証明書に代えて特定事業者の証明書1つで申告できるようになりました。10自治体に寄付していても、証明書は1ファイルで済みます。

マイナポータル連携ができないとき

マイナポータル連携は、ポータルサイト側が連携に対応していて、かつ利用者側で事前の連携設定が終わっていることが前提です。どちらかが欠けていると、確定申告書等作成コーナーで取得ボタンを押しても何も出てきません。

確認する順番はこれだけです。

1. 使ったポータルサイトが証明書の発行に対応しているか（＝特定事業者か）
2. その年の証明書の発行が始まっているか。発行時期はポータルごとに違い、年明け以降になることが多いです
3. マイナポータル側で、そのポータルサイトとの連携（外部サイトとの連携設定）が完了しているか

連携がうまくいかない場合、粘る必要はありません。ポータルサイトから証明書データを直接ダウンロードして、確定申告書等作成コーナーで読み込めば結果は同じです。

XMLデータが読み込めないとき

確定申告書等作成コーナーの「xmlデータの読込」で受け付けられるのは、拡張子が .xml の電子データです。次のどれかに当てはまっていないか確認してください。

• PDFを読ませようとしている：証明書をPDFでダウンロードしていると読み込めません。XML形式で取り直します
• スマホで開いてしまった：ブラウザ上で中身が表示されてしまい、ファイルとして保存できていないことがあります。保存してから読み込みます
• ファイルを展開していない：ZIPで配布される場合は、展開してから読み込みます

それでも読み込めないなら、手入力に切り替えてください。寄附金控除は、寄付先の所在地・名称・寄付額を入力すれば計算できます。証明書は手元に保管しておきます。

書面の証明書しかない場合

書面で受け取った証明書は、QRコード付証明書等作成システムでQRコード付きの証明書として出力できます。e-Taxで送信する場合はこれを使います。書面のまま提出する方法もあるので、申告のしかたに合わせて選んでください。

受領証明書・領収書をなくしたとき

紛失しても申告はできます。優先順位はこうです。

1. ポータルサイトの「寄附金控除に関する証明書」を取得する。年間分がまとまっているので、紙を探すより早い
2. ポータルが対応していない場合は、寄付先の自治体に再発行を依頼する

再発行は自治体ごとに手続きが違い、年末年始は依頼が集中して時間がかかります。申告期限に追われてから動くと間に合わないことがあるので、証明書が揃っているかは1月のうちに確認しておくと安全です。

複数のポータルサイトを使った場合

証明書はポータルサイトごとに発行されます。楽天とほかのサイトを併用したなら、それぞれで取得して両方読み込む必要があります。片方だけで申告すると、その分の控除が漏れます。

どのサイトで何件寄付したか分からなくなっている場合は、受領証明書の枚数と自治体名を突き合わせるのが確実です。ここを面倒がると、控除額が数千円〜数万円単位で変わります。

よくある質問

証明書はいつ発行されますか

ポータルサイトによって違いますが、その年の寄付が確定したあと（年明け以降）になるのが一般的です。12月に寄付した分が反映されるまで待つ必要があるためです。正確な時期は使っているポータルの案内で確認してください。

PDFの証明書では申告できませんか

電子データとして送信する場合、国税庁が指定する形式はXMLです。PDFはそのままでは使えません。ただし内容を見ながら手入力すれば申告できます。

ワンストップ特例の申請書を出した分も申告に含めますか

含めます。確定申告をするとワンストップ特例は無効になるため、その年に寄付した全件を入力します。詳しくはワンストップを忘れた・1月10日を過ぎたときの手順を参照してください。

申告を忘れたまま期限を過ぎました

還付申告は翌年1月1日から5年間できます。確定申告を忘れた・3月15日を過ぎた場合にまとめています。

つまずかないための順番

毎年同じところで止まらないために、1月中に証明書を集めてしまうのが結局いちばん早い方法です。使ったポータルを思い出し、証明書をダウンロードし、足りない分だけ自治体に依頼する。ここまで済ませておけば、申告そのものは30分ほどで終わります。

これから寄付するなら、限度額シミュレーションで上限を確認して、寄付額から選ぶ一覧から金額に合う返礼品を選んでください。使うポータルを1つに絞っておくと、証明書も1つで済みます。

出典

• 国税庁｜ふるさと納税に係る寄附金控除に関する証明書等について（特定事業者・XML形式・マイナポータル／ダウンロードでの受け取り）
• e-Tax｜QRコード付証明書等作成システムについて（書面の証明書の電子化）
• 国税庁｜No.1155 ふるさと納税（寄附金控除）（受領証明書に代えて特定事業者の証明書を添付できる）

※2026年9月時点の情報です。証明書の発行時期や手順はポータルサイト・自治体によって異なります。